La pasión por el béisbol ha llevado a Javier Anton a trabajar como entrenador en Venezuela, por muchos años ...
De 1991 a 1995 trabajo como entrenador y manager de la organización deportiva Gran Mariscal. De 1995 a 1999 fue entrenador y manager de la organización deportiva Azulejos.

En el 2003 paso a ser el entrenador y manager de la organización deportiva Lanceros y con la que estuvo hasta el 2008.
En la actualidad se desempeña en la organización Cachorros de La Boyera, como entrenador en todas las categorias y Manager del equipo juvenil, cuyas edades son de 17 y 18 años. Al mismo tiempo, representa en Venezuela a MVP Baseball Academy, donde tiene la responsabilidad de buscar jóvenes talentos, con las aptitudes necesarias para participar en el programa de la academia.